BÖLÜM 3
GEREÇ VE YÖNTEM
3.1.Mumps Virus Antijenlerinin
Elde Edilmesi
3.1.1. Virus
Çalışmamızda kullandığımız Mumps virusunun Enders Suşu, National Institue
of Public Healt Virology Department (Oslo/Norwey) orijinli olup, Gülhane
Askeri Tıp Akademisi Haydarpaşa Eğitim Hastanesi Mikrobiyoloji ve Klinik
Mikrobiyoloji servisinden sağlandı.
3.1.2. Hücre Kültürünün
Hazırlanması
Mumps virusunun üretiminde Afrika yeşil maymun böbrek hücre kültürü olan
vero hücreleri kullanıldı(33,38,39,43,88,91,92,95,96,105).
Hücre kültürü üretilmesinde,Minimal Essential Medium (MEM)
(Seromed, Biochrom KG, Cat no: T 051-10, Lot no: 7W 09) besi yerinden yararlanıldı.
MEM................9.7 gr.
Bidistile su....1000 ml
Toz madde suda eritildi.Filtrasyonla sterilize edildi. +40 C de saklandı.
(85,86,105).
Her 100 ml. Besiyerine,
Dana serumu (560 de 30 dakika inaktive edilmiş)...10 ml
NaHCO3 (%4.4)..................................................
.......2 ml
İlave edildi(11,55,85,86,95)
Bakteri ve mantar kontaminasyonunu önlemek amacıyla besiyerine streptomisin
(100?g/ml), penicillin G (100 U/ml),gentamisin (25??g/ml) ve flukonazol
(25 U/ml) ilave edildi. Besiyerinin pH’ı % 4.4 lük NaHCO3 ile 7.2-7.4’e
ayarlandı. Besi yerine esansiyel olmayan aminoasitler (Sigma MEM 50x, Cat
no: M7020, Lot no: 120H-4614) ve vitamin solusyonu (Sigma MEM 100x, Cat
no:M6895, Lot no: 90H-4629) ilave edildi (95,102).
Çalışmaların her aşaması, steril ünit içinde yapıldı. Çalıştığımız alanın
sterilizasyonunda, ultraviole lambaları kullanıldı. Kullandığımğz bütün
solusyonların, 370 C’ lik etüvde bekletilerek steril olduğunu önceden saptadığımız
kanlı agar plaklarına ekilerek kontaminasyon kontrolleri yapıldı.
Hücre kültürünün pasajı amacıyla PBS içerisinde % 0.25 lik tripsin solusyonu
kullanıldı.
Tripsin (Sigma T 0646 )
Tripsin
2500 mg
NaCl
8000 mg
KCl
200 mg
Na2 HPO4
1150 mg
KH2PO4
200 mg
Distile su
1000 ml
Bütün maddeler distile suda eritildi. PH 7.6 ya ayarlandı. Filtre edilerek
sterilizasyonu sağlandı. 50’şer mililitre vidalı kapaklı şişelere konularak
-400 C’de dipfrizde saklandı. Kullanışacağı zaman 370 C’lik benmaride
ısıtılıp ılık olarak hücre kültürlerinin pasajı amacıyla kullanıldı. (85).
Besiyeri döküldükten sonra monolayer hücre kültürlerinin üzerine % 0,25
lik tripsin ilave edildi. (11). Hücre üzerinde tripsin kısa bir süre tutulduktan
sonra şişe ters çevrilerek 370 C’lik etüve kaldırıldı. Bir süre etüvde
bekletilerek hücrelerin tripsinin etkisiyle şişe yüzeyinden ve birbirlerinde
ayrılması sağlandı. Tripsin atıldıktan sonra şişeye 12 ml. %10 fötal dana
serumlu hücre kültürü besi yerinden ilave edilerek iyice pipetlendi ve
hicrelerin birbirlerinden ayrılması sağlandı. Hücre süspansüyonu eşit büyüklükte
3 şişeye 4’er ml konuldu. Hücre hacminin % 10’u olacak şekilde fötal dana
serumlu MEM ilave edilerek 370 C’de inkübasyona bırakıldı. Her gün doku
kültürü mikroskobunda hücre kültürleri incelendi. 2 veya 3 gün sonra tek
katlı hücre tabakası oluşan şişe yüzeyini tam dolduran, normal görünümde
olan hücre kültürleri virus üretiminde kullanıldı (59,85). Saklamak istediğimiz
hücre kültüründeki besi yerleri dökülerek, üzerlerine %1 fötal dana serumu
içeren idame besi yeri ilave edildi ve beklemeye alındı. Bu şekilde beklemeye
alınan hücrelerin besi yerleri 5 günde bir değiştirildi.
3.1.3 Mumps Virusunun Vero
Hücre Kültüründe Üretilmesi
Doku kültür mikroskobunda kontrol edilen, normal olduğu saptanan ve %75-100
oranında şişe yüzeyini kaplayan hücrelerin virus üretimi için uygun olduğu
kabul edildi. Bu özellikleri taşıyan hücre kültürlerinin besiyeri dökülerek
ılık PBS ile yıkandı. Daha sonra Mumps virusunun stok solusyonundan 1 ml
hücre üzerine ilave edildi. Hafifçe çalkalanarak sıvının tüm yüzeye yayılması
sağlandı. Virusun hücrelere adsorbe olması amacıyla 370 C’de 1 saat bekletildi.
(60,85) Süre sonunda her şişeye % 1 fötal dana serumu içerem MEM besiyeri
ilave edilerek 370 C’lik etüvde virus üremeye bırakıldı. Virus ekili hücre
kültürü hergün mikroskopta kontrol edildi ve %75-100 oranında sitopatik
etki (CPE) görülen hücre kültürleri steril bir şişede toplandı ve –40 de
dipfrizde saklandı.
3.1.4.Antijen Elde Edilmesi
Mumps virusu ile enfekte edilmiş vero hücre kültürleri, üç defa dondurulup
çözülerek santrifüj tüplerine alındı. Hücre süspansiyonunun 5000 devirde
10 dk. Santrifüjlenmesiyle elde edilen süpernatant antijen olarak kullanıldı
(61).
3.1.5. Antijen Hemaglutinasyon
Titresinin Saptanması
Phosphate Buffer Saline (PBS): Eritrosit yıkama ve dilüsyonlarının hazırlanmasında
ve tüm testte sulandırıcı olarak PBS kullanıldı.
KCl
200 mg
NaCl
8000 mg
Na2 HPO4
910 mg
KH2PO4
120 mg
Distile su
1000 ml
Maddeler karıştırılıp suda eritildi. PH 7.2 ye ayarlandı ve 1200 C’de 30
dakika sterilize edildi. +40 C’de saklandı.(85,86)
Alsever Solusyonu:
Dextrose
20.5 gr
Sodyum citrate
8.0 gr
Citric acide
0.55 gr
Sodyum chloride
4.2 gr
Distile su
1000 ml
Bütün maddeler suda eritilip seitz filtresinden süzülerek sterilize edildi
ve kobay eritrositlerinin stabil olarak saklanmasında kullanıldı. Alsecer
solusyonu içine 1/3 oranında kan konuldu ve 40 C’de 1 gün bekletildikten
sonra kullanıldı. (86)
Kobay eritrositleri sağlıklı kobayların kalplerinden alındı ve 3 hafta
süreyle Alsever solusyonunda saklanarak kullanıldı.
Üretilen Mumps virusu antijenlerinin hemaglütinasyon titresinin belirlenmesi
amacıyla U çukurlu mikrotitrasyon pleytinde (8x12 Greiner 6501) hemaglütinasyon
testi yapıldı. Bu amaçla pleytlerin 2.3.4....8. çukurlarına 0.05 ml PBS
konuldu. 1 ve 2. çukura 0.05 ml Mumps virus antijeninden ilave edildi.
2. çukurdan itibaren 8. çukur dahil dilüsyon işlemi yapıldı. Bu amaçla
50 mikrolitrelik otomatik pipet kullanıldı. Son çukurdan 0.05 ml sıvı dışarı
atıldı. Bu şekilde viral antijenin 1/1,1/2,1/4,1/8,...1/128’lik dilusyonları
hazırlandı.
Alsever solüsyonunda saklanan taze kobay eritrositleri, 3 kez PBS ile yıkandıktan
sonra % 50’lik suspansiyonu hazırlandı. Tüm çukurlara %0.5 lik kobay eritrosit
süspansiyonundan 0.05 ml. konuldu. Eritrosit kontrolü olarak 3 kuyucuğa
0.05 ml PBS + 0.05 ml % 0.5 kobay eritrosit süspansiyonundan ilave edildi.
Buharlaşmaya engel olmak amacıyla transparan bir kapakla kapatılan pleytler
sarsıntısız ortamda ve oda ısısında 1 saat bekletildikten sonra değerlendirildi.
Test pleytlerinin değerlendirilmesinde önce eritrosit kontrol çukurlarına
bakıldı. Kontrol çukurlarında eritrositlerin görilmemesi halinde pleytler
değerlendirilmeye alındı.
Çukurlardaki eritrositlerin dantela tarzında görülmesi hemaglütinasyon
pozitif, düğme tarzında görülmesi halinde hemaglütinasyon negatif olarak
değerlendirildi. Hemaglütinasyon görülen en son çukurdaki virus sulandırımına
göre antijenin hemaglütinasyon titresi belirlendi. (2,42,47,86)
3.2 Hemaglütinasyon Önlenim
Testi ( HA-Ö) (61,87,94,95)
Daha önce hemaglutinasyon testi ile titresi saptanan Mumps virus antijenleri
tekrar test edilerek hemaglütinasyon titreleri belirlendi. Antijen 4 hemaglütinasyon
ünitesi (HÜ) virus içerecek çekilde sulandırıldı ve HA-Ö testinde antijen
olarak kullanıldı.
3.2.1 Test Serumları
GATA Haydarpaşa Eğitim Hastanesi Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji
servisi laboratuvarlarına çeşitli testler için gönderilen serumlardan ayrıldı
ve kullanılıncaya kadar –400C de saklandı.
3.2.2. Kontrol Serumlarının
Elde Edilmesi
Pozitif kontrol serum hemaglütinasyon titresi 1/64 olan Mumps virusundan,
tavşanlara 4‘er gün aralıklarla 4 kez deri altı ve bir kez damar içi yolla,
1’er ml enjekte edildi. Bir hafta sonra steril koşullarda tavşanların kanı
alındı ve serumları ayrıldı. Titreleri 1/320 ve 1/640 olarak saptandı ve
pozitif kontrol serumu olarak kullanıdı.
Negatif kontrol serum bağışıklanmamış normal tavşanlardan elde edildi.
3.2.3. Serumlardaki Nonspesifik
İnhibitörler ve Heterofil Antikorların Adsorbe Edilmesi.
Tüplere serum örneklerinde 0.1 ml konularak, ısıya duyarlı nonspesifik
inhibitörlerin ortadan kaldırılması amacıyla 56oC de 30 dakika inaktive
edildi(4,18,32,34,42,47,87). İnaktive serumların üzerine nonspesifik aglütininleri
ortadan kaldırmak için % 50’lik 0.6 ml kobay eritrosit süspansiyonu ilave
edildi. Tüpler iyice çalkalandıktan sonra oda sıcaklığında 30 dakika bekletildi.
Daha sonra 3000 devirde 15 dakika santrifüj edildi. Serumda bulunabilen
ısıya dayanıklı nonspesifik inhibitörlerin inaktive edilmesi için sodyum
periyodattan yararlanıldı(32,34,42). Bu amaçla taze hazırlanan 0.1 M sodyum
periyodat’dan 0.3 ml ilave edildi. Karışım 37oC’de 30 dakika bekletildi.
Üzerine 0.3 ml %40 glukoz solusyonu ilave edildi. Böylece serum dilüsyonunun
1/10 olması sağlandı.
3.2.4 Hemaglütinasyon Önlenim
Testini Yapılışı
- U çukurlu mikropleytlerin 3.4.5.6......12. çukurlarına 0.05 ml PBS ilave
edilerek, her sıra bir serum örneği için ayrıldı. Her sıranın 1,2 ve 3.
çukurlarına 1/10 serum dilüsyonundan 0.05 ml ilave edildi.
- 3. çukurdan itibaren serumlar, 50?l’lik otomatik pipetle dilue edildi.
12. çukurdan 0.05 ml sıvı dışarı atıldı. Böylece serumların 1/10’dan 1/10240’a
kadar dilusyonları yapılmış oldu.
- Her sıranın ilk çukurları hasta serum kontrolleri için ayrıldı ve bunlara
antijen ilave edilmedi.
- 1. çukur hariç bütün çukurlara 0.05 ml HÜ antijen ilave edildi ve pleytler
çalkalanıp 1 saat oda ısısında bekletildi. Bu süre içinde antijen-antikor
reaksiyonunun gerçekleşmesi beklendi.
? Bütün çukurlara %0.5 kobay eritrosit süspansiyonundan
0.05 ml ilave edildi. Pleytler tekrar çalkalandı. 1 saat oda ısısında bekletildi
ve süre sonunda sonuçlar değerlendirildi.
HA-Ö Testinde Yer Alan Kontroller:
- 3 çukur virus kontrolü:
0.05 ml PBS+0.05 ml 4HÜ virus antijeni+0.05 ml %50’lik eritrosit süspansiyonu
-
3 çukur eritrosit kontrolü:
0.1ml PBS+0.05 ml %0.5 eritrosit süspansiyonu
-
Hasta serum kontrolü:
Her sıranın ilk çukuru 0.05 ml serum+0.05 ml %0.5 eritrosit süspansiyonu
- Pozitif ve negatif serum kontrolleri:
0.05 ml serum(pozitif ve negatif)+ 4HÜ virus antijeni+0.05 ml %50’lik eritrosit
süspansiyonu
Sonuçların değerlendirilmesi:
Pleytlerin değerlendirilmesinde önce kontrol çukurlarına bakıldı. Eritrosit,
hasta serumu ve pozitif kontrol serumu içeren kontrol çukurlarında hemaglütinasyonun
görülmemesi, buna karşın virus ve negatif serum içeren kontrol çukurlarında
hemaglütinasyon görülmesi halinde, testin değerlendirilmesine geçildi.
Pleytin her serum sırasında, hemaglütinasyonun önlendiği son çukurdaki
serum dilusyonu, hemaglütinasyon önlenim antikorlarının titresi olarak
belirlendi.
3.3. ELISA Testinin Uygulanması
Kaplama ve yıkama solusyonlarının hazırlanışı
Kaplama Solüsyonu pH 9.6 Coating Buffer)
NaCO3
1.59 gr
NaHCO3
2.93 gr
NaN3
0.2 gr
Maddeler 1 litre distile suda eritildi ve pH 9.6 ya ayarlandı. Oda ısısında
2 hafta saklandı (20,22,63,70,114)
Yıkama Solusyonu:
NaCl
8.0 gr
KH2 PO4
0.2 gr
NaH2PO4 .12 H2O
2.9 gr
KCL
0.2 gr
NaN3
0.2 gr
Tween 20
0.5 ml
Maddeler 1 lt suda eritildi ve buzdolabında saklandı ( 20,63,70,114).
3.3.1. Mumps Antijeninin
ELISA Testi Icin Optimal Dilusyonunun Saptanması:
HA-Ö testi ile pozitif ve negatif olduğu saptanan serumlar, kontrol serumu
olarak kullanıldı. Bu serum ların 1/100 – 1/800 arası iki katlı dilusyonları
ile Mumps antijeninin ¼,1/8,1/16,1/32 dilusyonları test edildi ve böylece
optimal dilusyonları belirlendi (14,19).
3.3.2. ELISA Striplerine
Mumps Antijeninin Kaplanması
Vero hücre kültüründe hazırlanan Mumps antijewni, kaplama solusyonu ile
1/16 oranında sulandırıldı. Yüksek düzeyde protein bağlama kapasiteli 96
çukurlu dü tabanlı polistiren mikro ELISA pleytleri (granier 756071) katı
faz olarak kullanıldı( 9,14,22,39,41,43,76,96,105).
Striplerin her kuyucuğuna, kaplama solusyonu ile dlue edilmiş antijenden
0.1 mlş ilave edildi. Buzdolabında, nemli ortanda bir gece bekletildi.
Ertesi gün pleytlerdeki antijen aspire edildikten sonra % 0.05 Tween 20
içeren yıkama solusyonu ile 3 kez yıkandı (31,39,41,43,59,67,68,76,88,92,96).
Daha sonra bloklama işlemi yapıldı. Bu amaçla 5 0.05 Tween 20 içeren 0.15
M PBS içerisinde hazırlanmış %1‘lik yağsız süt tozu kullanıldı. Pleytin
bütün çukurlarına taze hazırlanmış blok solusyonundan 0.2’şer ml ilave
edildi. 370C’ de 1 saat inkübe edildikten sonra, yıkama solüsyonu ile 3
kez yıkanıp kurutuldu. Naylon torbalara yerleştirilerek kullanılıncaya
kadar buzdolabında saklandı (709
3.3.3. Kontrol Antijenlerinin
ELISA Striplerine Kaplanması
Virusla enfekte edilmemiş vero hücre kültürü, kontrol antijeni olarak kullanıldı.
Bu amaçla vero hücre kültürü,-400c’lik dipfrizde 3 defa dondurulup çözülerek,
hücrelerin parçalanması sağlandı ve daha sonra 5000 devirde 10 dakika santrifüjlenerek
elde edilen süper natant, antijen olarak kullanıldı.
Süpernatant, kaplama solüsyonu ile 1/16 oranında sulandırıldı ve ELİSA
Striplerine kaplandı.
3.3.4. Konjugatlar
Çalışmamızda keçi orijinli anti –human IgG ve IgM peroksidazlı konjugatlar
kullanıldı. ( Anti IgG konj. Sigma a8775, 28F 8922) (Anti IgM konj. Sigma
A-8650, 48F 8814). IgG ve IgM konjugatların 1/1000 sulandırımları kullanıldı
(88,92)
3.3.5. Substrat
Substrat olarak, Orto-fenilen diamin hidroklorür (OPD) den (Sigma P6912)
yararlanıldı. Fosfat sitrat tamponu (25.7 ml 0.2 M dibazik sodtum fosfat
+ 24.3 ml 0.1 M sitrik asit + 50 ml deiyonize su pH 5) ile %0.04 OPD +
%0.012 H2O2 konsantrasyonlarında taze olarak hazırlandı ve 10 dakika içinde
kullanıldı (70).
3.3.6. Testin Uygulanışı
Test serumları ile kontrol serumları, vero hücre lizatı ile muamele edildi.
Bu amaçla 0.25 ml serum üzerine 0.25 ml hücre lizatı ilave edildi. 1 saat
370 C’de bekletildi. Daha sonra % 1 sığır serum albumini ilave edilmiş
% 0.05 Tweeen 20’li PBS ile 2.5 ml’ye tamamlanarak serumların 1/10’lük
dilusyonları hazırlandı.(14,88,92). Daha önce hazırlanan Mumps virus antijeni
ile kaplı 96 çukurlu mikro ELISA stripleriinn, ilk 4 çukuru PBS, negatif
ve pozitif kontrol için, kalan diğer çukurlar ise test serumları için kullanıldı.
Her çukura 1/10’lük serum dilusyonundan 0.1 ml ilave edildikten sonra,
pleytler çalkalandı ve 370C’ de nemli ortamda 1 saat inkubasyona bırakıldı
(41). I gG ve IgM antikorlarının saptanmasında aynı işlemler ayrı ayrı
yapıldı. Striplerdeki serum dilusyonları aspire edildikten sonra yıkama
solusyonu ile ve yarı otomatik yıkayıcı ile 3 defa 1’er dakika aralıklarla
yıkandı. Peroksidaz ile işaretli anti-human IgG ve IgM konjugatlar,% 1
fötal dana serumlu PBS-Tween ile 1/1000 sulandırıldı. Her çukura 0.1 ml
ilave edildikten sonra 370C’ de 1 saat bekletilerek aspirasyon işlemi yapıldı
ve 3 defa yıkandı. Yıkama işlemini takiben taze hazırlanmış substrat (orto
fenilen diamin dihidroklorür) solüsyonundan 1’er ml ilave edildi. 370C’
de 30 dakika bekletildi. Reaksiyon, her çukura 0.05 ml 1 NH2SO4 ilavesi
ile durduruldu. Absorbanslar 490 nm de Biotek Instruments Mikropleyt Reader’da
okundu.(88)
Tüm serumlar yukarıda belirtildiği tarzda, kontrol antijenleri ile de test
edildi.
Sonuçların değerlendirilmesi:
Negatif kontrol serum absorbanslarının ortalaması alınarak bulunan değere
0.15 eklendi ve cut-off değeri hesaplandı. Bulunan bu değerin %10 fazlasına
kadar absorbans değerleri negatif, bunun üzerindeki değerler pozitif olarak
değerlendirildi.
ELISA IgM testinde romatoid faktörün de dikkate alınması gerektiği düşüncesinden
hareketle, tüm serumlarda lateks testi (Behring. Rapi Tex RF 193820C) ile
romatoid faktör araştırıldı (40).
3.3.7. Ticari ELISA Mumps
Kiti:
88 serumda Virotech Mumps ELISA kiti ile tarifine uygun olarak çalışıldı.
3.3.8. İstatistik
Hemaglütinasyon Önlenim Testinin sonuçlarının duyarlılık, özgüllük ve negatif
,pozitif prediktivite, prediktivite etkiinliği literatürdeki formüllere
göre hesaplandı (103). |